綠島每年遊客量高達40萬人次，不僅帶來豐厚的觀光收入，連帶也將污染留在綠島。大批觀光客及居民所產生的大量廢水，都未經處理就直接排放到海裡，原本美麗的珊瑚礁迅速黑化，像藍綠藻的海綿覆蓋在珊瑚上形成薄膜，覆蓋率達12%，蔓延速度相當快，可能導致珊瑚礁大量死亡。

目前尚無法確定珊瑚礁病變的因素，最可能的原因直指「廢水污染」，內政部營建署正規劃興建廢水處理廠的可能性。但最根本的治療方法，是人類必須改變對待大自然的方式，否則當無法再承受人類給予的污染，自然會發生反撲，帶來災害。